More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0361 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0361  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 398 aa  814    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  69.13 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  66.58 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 414 aa  528  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.21 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  62.53 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.9 
 
 		 401 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.29 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 413 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 411 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  61.32 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  61.03 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 406 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 393 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 405 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 431 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 410 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 413 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>