182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2184 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.75 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.93 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.9 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  51.16 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.16 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.76 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.62 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.04 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.6 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.2 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.76 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.63 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.08 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  35.96 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  35.96 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.74 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  36.84 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  30.59 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  40.79 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  36.36 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.93 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.96 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.88 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.16 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.53 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5479  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  32.58 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.87 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
100 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  39.47 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  39.47 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.19 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  32.61 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40.28 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.82 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.93 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.56 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  34.57 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.94 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.05 
 
 
101 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  46.97 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.64 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  33.33 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.24 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  36.05 
 
 
1365 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2019  plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.48 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.25 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.64 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  35.53 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  35.53 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.53 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0214  virulence-associated protein, putative  37.23 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.756652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.53 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  35.53 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  35.53 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  35.53 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  34.15 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3283  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.03 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>