More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0019 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0019  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
342 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  64.24 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  55.27 
 
 
354 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  56.47 
 
 
350 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  55.86 
 
 
342 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  54.79 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
344 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  55.26 
 
 
344 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  56.64 
 
 
372 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
344 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  55.69 
 
 
350 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  55.69 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  54.65 
 
 
343 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  54.95 
 
 
343 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  56.97 
 
 
375 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2084  hypothetical protein  55.56 
 
 
356 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  55.86 
 
 
344 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.26 
 
 
344 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
344 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  55.26 
 
 
344 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  51.46 
 
 
355 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.56 
 
 
344 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3659  glycosyl transferase, group 1  51.18 
 
 
354 aa  342  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631125  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  54.88 
 
 
352 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  52.33 
 
 
363 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1992  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
368 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.984548  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  54.27 
 
 
349 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  55.87 
 
 
521 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  50.6 
 
 
345 aa  328  9e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  48.94 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  54.57 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  48.64 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0133  glycosyl transferase, group 1  52.55 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.865411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 
355 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4490  glycosyl transferase group 1  53.35 
 
 
351 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  50.6 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0579  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0114  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 
360 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.17122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  50.75 
 
 
333 aa  318  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  50.89 
 
 
356 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  49.7 
 
 
394 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1312  glycosyl transferase, group 1  52.41 
 
 
349 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4972  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 
365 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  50.45 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  53.27 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1745  glycosyl transferase group 1  51.98 
 
 
358 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0727463  normal  0.415071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  49.24 
 
 
351 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  49.12 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4943  glycosyl transferase group 1  51.52 
 
 
378 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  47.34 
 
 
367 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1909  glycosyl transferase, group 1  50.91 
 
 
351 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0853148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  50.59 
 
 
350 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  45.24 
 
 
367 aa  298  7e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  51.35 
 
 
353 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  48.34 
 
 
353 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  49.85 
 
 
345 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1793  glycosyl transferase group 1  53.77 
 
 
358 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2129  glycosyl transferase group 1  53.42 
 
 
358 aa  292  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  49.39 
 
 
351 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1601  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 
355 aa  279  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2293  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 
367 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  36.45 
 
 
393 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
396 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  34.53 
 
 
385 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
404 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
396 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.24 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.42 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
377 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
381 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
377 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.32 
 
 
403 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
390 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
377 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
377 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
376 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
380 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
373 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  34.29 
 
 
381 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
374 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
383 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
380 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
380 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.29 
 
 
373 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
381 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
380 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
380 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.57 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
381 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>