278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1576 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  51.16 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  53.57 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  53.57 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  52.38 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  53.49 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  39.53 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  52.63 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  43.59 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  40.74 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  40.51 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  39.44 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  49.12 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  47.95 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  43.42 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.71 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  49.12 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  36.99 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  40.26 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  35.44 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  50.88 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  37.18 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  38.67 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  36.25 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  49.12 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  44.74 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  48.21 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  44.74 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.73 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  44.64 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>