More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1449 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  38.61 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  33.99 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  33.17 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.18 
 
 		 218 aa  104  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  34.3 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  32.38 
 
 		 229 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  31.88 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.6 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  27.52 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  27.64 
 
 		 307 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 305 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  25.14 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  27.84 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.75 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.06 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  24.58 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  30.16 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.64 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  27.78 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  25.89 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 348 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 288 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.58 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 312 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  29.51 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 250 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 268 aa  51.6  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.36 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  28.65 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  24.6 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  24.86 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  25.14 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  28.7 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.19 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.76 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.36 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 259 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 339 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.69 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.5 
 
 		 325 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.19 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  24.16 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 340 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  24.6 
 
 		 324 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  22.47 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.12 
 
 		 558 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.34 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  26.77 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  24.4 
 
 		 335 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 349 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 307 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>