More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3921 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  99 
 
 		 100 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  71.29 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  72.92 
 
 		 99 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  72.04 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  69.7 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  67.71 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  67.96 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  66.67 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  66.67 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  66.67 
 
 		 100 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  65.98 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  67.33 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  68.42 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  68.09 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  68.42 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  68.82 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  64.65 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  68.04 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  64.29 
 
 		 99 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  64.65 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  66.67 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  65.98 
 
 		 100 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  65.69 
 
 		 101 aa  126  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  64.36 
 
 		 100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  64.21 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  64.21 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  58.59 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  58.59 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  65.26 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  64.21 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  68.75 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  61.22 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  58.76 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  60.87 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  57.73 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.06 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 94 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 94 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  48.39 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  50.54 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.61 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  46.32 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  45.35 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  47.47 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  43.96 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  43.3 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  43.3 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  48.24 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  43.3 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  44.57 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.3 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  42.53 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  48.75 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0479  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  41.24 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>