More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2520 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
577 aa  1097    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  89.08 
 
 
574 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.07 
 
 
611 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  55.99 
 
 
561 aa  498  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.8 
 
 
958 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.7 
 
 
800 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  69.64 
 
 
810 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.38 
 
 
778 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.28 
 
 
623 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.17 
 
 
623 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.51 
 
 
631 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  35.63 
 
 
663 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.24 
 
 
837 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  41.14 
 
 
655 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.7 
 
 
629 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.42 
 
 
867 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.13 
 
 
537 aa  289  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.51 
 
 
593 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  33.33 
 
 
593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.4 
 
 
612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.11 
 
 
600 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  30.04 
 
 
606 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.95 
 
 
600 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  34.4 
 
 
620 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.73 
 
 
604 aa  266  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  36.6 
 
 
594 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  36.75 
 
 
579 aa  252  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.14 
 
 
284 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  35.12 
 
 
567 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.9 
 
 
451 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  34.3 
 
 
564 aa  220  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  34.48 
 
 
581 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  34.19 
 
 
567 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  33.33 
 
 
574 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.66 
 
 
240 aa  217  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.57 
 
 
601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.39 
 
 
468 aa  214  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.66 
 
 
567 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.41 
 
 
263 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.63 
 
 
563 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.65 
 
 
572 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
241 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
241 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
241 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
241 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.42 
 
 
240 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.51 
 
 
240 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.36 
 
 
565 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 
253 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  30.42 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.28 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  46.59 
 
 
331 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.03 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  42.68 
 
 
241 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.55 
 
 
572 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.88 
 
 
236 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.32 
 
 
243 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.74 
 
 
244 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  47.41 
 
 
772 aa  194  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.9 
 
 
777 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  46.94 
 
 
329 aa  193  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  46.94 
 
 
329 aa  193  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  43.9 
 
 
458 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.74 
 
 
250 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  51.04 
 
 
797 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.5 
 
 
242 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.43 
 
 
776 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.07 
 
 
560 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.24 
 
 
567 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  44.08 
 
 
326 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.53 
 
 
327 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.5 
 
 
481 aa  187  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  41.18 
 
 
238 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.02 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.15 
 
 
331 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.89 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  43.27 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
329 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.73 
 
 
596 aa  184  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  42.68 
 
 
287 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 
328 aa  181  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.26 
 
 
571 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  32.83 
 
 
551 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  43.66 
 
 
495 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  34.85 
 
 
559 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 
787 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.36 
 
 
520 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.6 
 
 
257 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.44 
 
 
236 aa  176  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  35.34 
 
 
579 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.44 
 
 
347 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  43.28 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  43.28 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.16 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  50.83 
 
 
241 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  40 
 
 
267 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>