285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1571 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  94.85 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  54.63 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  53.81 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  50.88 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  51.97 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  49.34 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  51.06 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  49.57 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  47.6 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  48.03 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  47.95 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  45.5 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  45.45 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  46.51 
 
 		 226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  51.79 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  46.5 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  44.02 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  45.37 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  45.37 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  44.93 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  38.15 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  31.05 
 
 		 212 aa  98.6  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  49.43 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.66 
 
 		 646 aa  95.1  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  49.43 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  48.85 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.47 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.71 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.22 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  41.28 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  36.65 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.46 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  33.61 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  32.12 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.14 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  38.25 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  38.66 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.03 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  39.22 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.68 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  28.49 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  40.76 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  38.04 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  38.04 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  32.79 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  38.68 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  43.62 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  38.42 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  36.08 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  30.5 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  31.43 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  35.56 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30.5 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2396  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  37.28 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  39.33 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  40.85 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  39.89 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  37.28 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  36.18 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  30.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  30.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  36.5 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.86 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.53 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  36.11 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  34.55 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  24.49 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  33.89 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.68 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  36.7 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.86 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.74 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.75 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  29.34 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.02 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>