49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2620 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  371  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  32.28 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  32.28 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  32.28 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  29.47 
 
 
190 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  31.22 
 
 
189 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  31.25 
 
 
181 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  29.38 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  23.37 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  24.14 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  22.53 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.42 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  26.14 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  35.42 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  25.14 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  54.7  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.43 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  27.17 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  25.86 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  23.73 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  22.99 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  22.02 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  20.47 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  21.93 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  22.75 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  24.57 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  22.67 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  22.67 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  23.31 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  23.4 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  24.38 
 
 
255 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  22.73 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  22.73 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  22.73 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  25.38 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.79 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  22.58 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  28.08 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0084  hypothetical protein  29.79 
 
 
175 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105076  normal  0.179004 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  25.81 
 
 
169 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  22.88 
 
 
182 aa  41.6  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  31.68 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>