46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2209 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 113 aa  223  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  45.28 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  36.45 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  34.95 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  31.18 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  37.93 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  34.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  31.25 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1619  DNA polymerase beta domain-containing protein region  42.62 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  41.43 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  51.22 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.81 
 
 		 260 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  42.22 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  41.27 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  46.51 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.51 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  24.74 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  52.63 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  58.33 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  34.33 
 
 		 260 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  38.96 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  32.88 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  41.82 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  66.67 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  69.57 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0837  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  27.14 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  32.81 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>