More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1224 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  100 
 
 
405 aa  799  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  69.17 
 
 
402 aa  520  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  46.19 
 
 
405 aa  357  2e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  49.25 
 
 
408 aa  350  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  45.9 
 
 
403 aa  348  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  45.82 
 
 
402 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.19 
 
 
403 aa  335  8e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  48.23 
 
 
402 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  45.83 
 
 
402 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  45.81 
 
 
404 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  46.67 
 
 
402 aa  316  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  43.21 
 
 
403 aa  315  7e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.44 
 
 
403 aa  315  1e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.19 
 
 
403 aa  313  3e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  44.97 
 
 
402 aa  313  5e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.43 
 
 
403 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.25 
 
 
403 aa  309  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  40.81 
 
 
402 aa  308  1e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  307  2e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  45.77 
 
 
416 aa  304  2e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  42.32 
 
 
403 aa  303  3e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.19 
 
 
404 aa  303  4e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  44.86 
 
 
402 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.57 
 
 
403 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.57 
 
 
403 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  44.25 
 
 
401 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  44.25 
 
 
401 aa  300  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  43.31 
 
 
403 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  44.88 
 
 
408 aa  299  6e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  44.27 
 
 
403 aa  295  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  43.75 
 
 
403 aa  295  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  42.71 
 
 
400 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  45.08 
 
 
418 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  44.5 
 
 
401 aa  293  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  40.66 
 
 
403 aa  291  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  38.83 
 
 
402 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.67 
 
 
413 aa  289  5e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.73 
 
 
401 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  42.78 
 
 
411 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.22 
 
 
395 aa  286  6e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  42.26 
 
 
403 aa  285  1e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.38 
 
 
402 aa  284  2e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  43.48 
 
 
406 aa  284  2e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  44.85 
 
 
403 aa  284  2e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  43.8 
 
 
410 aa  283  3e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.34 
 
 
402 aa  283  5e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.08 
 
 
407 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  38.36 
 
 
412 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  43.64 
 
 
402 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41 
 
 
399 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40 
 
 
403 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  38.19 
 
 
415 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  44.66 
 
 
400 aa  274  2e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  42.13 
 
 
402 aa  273  5e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.74 
 
 
414 aa  272  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.34 
 
 
409 aa  272  8e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.65 
 
 
537 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  46.35 
 
 
410 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.21 
 
 
406 aa  270  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  42.46 
 
 
402 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.52 
 
 
400 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  45.88 
 
 
402 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.0709e-12 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  37.82 
 
 
401 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  44.22 
 
 
402 aa  263  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  41 
 
 
408 aa  262  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.25 
 
 
412 aa  262  9e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  39.5 
 
 
403 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  42.98 
 
 
415 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  41.52 
 
 
411 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  45.28 
 
 
358 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.15 
 
 
406 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  37.82 
 
 
404 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  38.02 
 
 
412 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  40.15 
 
 
443 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.13 
 
 
410 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.66 
 
 
421 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  37.72 
 
 
403 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  48.59 
 
 
333 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  48.59 
 
 
333 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  37.59 
 
 
412 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  41.73 
 
 
403 aa  253  4e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  48.59 
 
 
333 aa  253  4e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  48.59 
 
 
333 aa  253  4e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  48.59 
 
 
333 aa  253  5e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  38.42 
 
 
404 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  48.28 
 
 
333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  38.52 
 
 
411 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.52 
 
 
403 aa  250  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.89 
 
 
402 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  43.73 
 
 
399 aa  249  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  43.73 
 
 
399 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  49.84 
 
 
333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  49.53 
 
 
333 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  47.95 
 
 
346 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  48.28 
 
 
333 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  47.95 
 
 
346 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  40 
 
 
415 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  41.06 
 
 
398 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  37.94 
 
 
403 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  39.05 
 
 
412 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>