More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0508 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  100 
 
 		 326 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  85.58 
 
 		 326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  85.58 
 
 		 326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  85.58 
 
 		 326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  85.58 
 
 		 326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  85.89 
 
 		 326 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  86.11 
 
 		 324 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  74.29 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  74.29 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  71.79 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  41.61 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  41.3 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  41.03 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  38.94 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  39.42 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  36.62 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  35.98 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.05 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  39.56 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  37.3 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.4 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  40.75 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  38.82 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  38.8 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  35.57 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.71 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 		 302 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.24 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  32.63 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  35.8 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  36.86 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  34.07 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  34.78 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  34.78 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  33.98 
 
 		 311 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  34.49 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  34.18 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  34.18 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  34.49 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  34.18 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  34.18 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  35.13 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  32.02 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.64 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  33.54 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  32.91 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  31.31 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  31.31 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.07 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  30.98 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.56 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  32.89 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  28.8 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  30.59 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  33.89 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  28.71 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  34.64 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  34.12 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  30.57 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  32.67 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  31.58 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  31.68 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  31.68 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  31.35 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  31.35 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  33.45 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  34.01 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  33.45 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  33.11 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  33.45 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  32.77 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  33.45 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  31.23 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  32.09 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  30.41 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.23 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  30.33 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  33.11 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  32.1 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  32 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  30.69 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  29.35 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  34 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  31.56 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  33.11 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  31.76 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  31.56 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  30.41 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  31.23 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  33.78 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>