164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5643 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  55.82 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  54.42 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  55.14 
 
 		 303 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  49.83 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  50.5 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  49.82 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  45.52 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  52.65 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  44.75 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  46.26 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  46.69 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  44.33 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.82 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  43.01 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  48.22 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  45.86 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  44.86 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  46.35 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  45.88 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  45.57 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  43.92 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  43.92 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  43.92 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  45.61 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  48.99 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  46.76 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  47.62 
 
 		 279 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  44.86 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  44.9 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  44.9 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  44.9 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  45.51 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.36 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  48.54 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  37.86 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  35.55 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.17 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.25 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  30.43 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  31.77 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  31.77 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  31.77 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  30.29 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.68 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.83 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  28.99 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  28.99 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.96 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.67 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  28.62 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  28.62 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  28.62 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.91 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.43 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.56 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.91 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  27.54 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.73 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  25.56 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.77 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  28.27 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  33.87 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.96 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.39 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.71 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.98 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  28.8 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.51 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  28.88 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  27.41 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  24.47 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  27.65 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.41 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.86 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.52 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.69 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.1 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  28.57 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.49 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.63 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  32.04 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  28.94 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.96 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.15 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  24.52 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>