81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2910 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  100 
 
 		 900 aa  1871    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  46.76 
 
 		 517 aa  360  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  46.15 
 
 		 517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  36.19 
 
 		 687 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.61 
 
 		 722 aa  313  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.88 
 
 		 605 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  37.85 
 
 		 662 aa  281  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  62.5 
 
 		 862 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  39.3 
 
 		 603 aa  280  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  58.74 
 
 		 696 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  39.11 
 
 		 598 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  43.9 
 
 		 845 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  49.78 
 
 		 678 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  50.51 
 
 		 587 aa  205  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  52.26 
 
 		 834 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.38 
 
 		 685 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  52.02 
 
 		 685 aa  194  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  51.26 
 
 		 691 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.88 
 
 		 723 aa  190  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.05 
 
 		 530 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.55 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  30.21 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  42.34 
 
 		 851 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  40.85 
 
 		 999 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.7 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  33.98 
 
 		 498 aa  147  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  40.89 
 
 		 666 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  44.89 
 
 		 822 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  45.05 
 
 		 700 aa  145  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  34.38 
 
 		 498 aa  143  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 		 683 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.74 
 
 		 754 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  45.28 
 
 		 705 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.07 
 
 		 603 aa  134  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  44.89 
 
 		 609 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  47.37 
 
 		 481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  44.89 
 
 		 609 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  40.22 
 
 		 459 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  40.22 
 
 		 459 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.54 
 
 		 465 aa  118  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  40.23 
 
 		 810 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.97 
 
 		 421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  38.64 
 
 		 781 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.88 
 
 		 732 aa  111  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.21 
 
 		 795 aa  110  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40 
 
 		 698 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  37.91 
 
 		 805 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  38.95 
 
 		 539 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  38.55 
 
 		 734 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  44.44 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.12 
 
 		 626 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.55 
 
 		 743 aa  104  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.56 
 
 		 502 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.59 
 
 		 568 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  37.87 
 
 		 629 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  37.08 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  58.14 
 
 		 655 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  36.63 
 
 		 853 aa  97.8  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  38.18 
 
 		 899 aa  92.8  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.37 
 
 		 729 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  31.01 
 
 		 638 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  37.06 
 
 		 303 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.47 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 		 590 aa  77.8  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.59 
 
 		 585 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  25.59 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  24.43 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  43.18 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  33.57 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  29.05 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  28.95 
 
 		 513 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.28 
 
 		 410 aa  55.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.06 
 
 		 748 aa  54.7  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.15 
 
 		 651 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.93 
 
 		 449 aa  52.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.85 
 
 		 530 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  30.56 
 
 		 938 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  35.51 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  35.71 
 
 		 523 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0225  conserved hypothetical protein, putative endonuclease  54.05 
 
 		 208 aa  44.7  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.131581  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.61 
 
 		 597 aa  44.3  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>