More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0623 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  89.42 
 
 
208 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  89.42 
 
 
208 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  89.42 
 
 
208 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  88.94 
 
 
208 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  80.86 
 
 
208 aa  348  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  80.86 
 
 
208 aa  346  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  78.85 
 
 
208 aa  342  3e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  79.9 
 
 
208 aa  312  3e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  69.1 
 
 
204 aa  261  7e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  63.84 
 
 
199 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  63.84 
 
 
210 aa  244  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  44.69 
 
 
203 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  43.72 
 
 
210 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  47.43 
 
 
216 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  46.63 
 
 
216 aa  139  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  45.14 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  45.14 
 
 
217 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  40.43 
 
 
226 aa  134  1e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  38.71 
 
 
215 aa  133  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  41.48 
 
 
262 aa  130  1e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  41.81 
 
 
217 aa  130  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  41.81 
 
 
217 aa  130  2e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  36.51 
 
 
237 aa  129  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  40.8 
 
 
224 aa  127  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.76036e-06  hitchhiker  2.15746e-05 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  41.24 
 
 
220 aa  127  1e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.57 
 
 
206 aa  126  2e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.45105e-09  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  42.44 
 
 
267 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  39.78 
 
 
207 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  40.78 
 
 
256 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.14 
 
 
206 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.56417e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.5 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  37.5 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.36847e-08  unclonable  5.12206e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  37.5 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.02028e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.57 
 
 
223 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  37.5 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.04 
 
 
207 aa  118  5e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.04 
 
 
207 aa  118  5e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.04 
 
 
207 aa  118  5e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  39.11 
 
 
213 aa  117  8e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
207 aa  117  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.91 
 
 
207 aa  117  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.2 
 
 
208 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  33.98 
 
 
200 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.46 
 
 
205 aa  115  7e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.7 
 
 
205 aa  114  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  34.05 
 
 
206 aa  113  2e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  7.81089e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
211 aa  113  2e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  40.21 
 
 
228 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.07 
 
 
206 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  33.49 
 
 
219 aa  112  4e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  35.63 
 
 
318 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.33 
 
 
206 aa  111  8e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  35.07 
 
 
205 aa  110  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.16 
 
 
206 aa  110  2e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.59 
 
 
207 aa  110  2e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.88 
 
 
209 aa  110  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  37.5 
 
 
246 aa  110  2e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  34.29 
 
 
219 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.65 
 
 
229 aa  107  9e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.14 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.57 
 
 
205 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  34.27 
 
 
205 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.63 
 
 
271 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  36.11 
 
 
223 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  35.47 
 
 
219 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  32.54 
 
 
200 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  34.76 
 
 
217 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  34.76 
 
 
217 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  34.76 
 
 
217 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  31.34 
 
 
209 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  36.02 
 
 
217 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  34.58 
 
 
213 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  34.58 
 
 
213 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  31.37 
 
 
243 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.52 
 
 
225 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.71 
 
 
202 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.37 
 
 
243 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  34.3 
 
 
219 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  38.04 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  34.66 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  34.76 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  31.71 
 
 
239 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
218 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.33 
 
 
222 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.9 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.9 
 
 
205 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  33.33 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  33.9 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  32.85 
 
 
222 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  34.21 
 
 
196 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  35.45 
 
 
217 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  34.09 
 
 
269 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  35.45 
 
 
217 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  35.96 
 
 
236 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  35.03 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  35.03 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  37.5 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  3.11228e-08 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  35.03 
 
 
236 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.203421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>