More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2235 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  78.45 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  78.45 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  78.45 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  77.73 
 
 		 235 aa  357  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  81.99 
 
 		 235 aa  351  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  73.48 
 
 		 230 aa  346  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  79.48 
 
 		 230 aa  336  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  79.04 
 
 		 230 aa  334  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  79.04 
 
 		 230 aa  334  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  79.04 
 
 		 230 aa  334  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  74.32 
 
 		 231 aa  333  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  78.6 
 
 		 230 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  78.02 
 
 		 228 aa  331  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  77.63 
 
 		 231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  77.63 
 
 		 231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  77.63 
 
 		 231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  77.63 
 
 		 231 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  81.04 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  81.04 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  81.04 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  81.04 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  81.04 
 
 		 231 aa  321  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  64.66 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  64.66 
 
 		 228 aa  301  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  67.13 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  64.22 
 
 		 230 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  65.09 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  64.32 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  65.74 
 
 		 231 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  64.41 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  65.26 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  62.34 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  64.98 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  64.98 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  61.9 
 
 		 232 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  61.47 
 
 		 232 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  64.81 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  62.39 
 
 		 231 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  60.61 
 
 		 232 aa  277  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  59.73 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  62.91 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  60.78 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  61.5 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  58.1 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  51.75 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  55.51 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  50.44 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  49.56 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  57.56 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  52.07 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  51.75 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.77 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  54.73 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  48.15 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  51.21 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  51.44 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  48.65 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  50.7 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.77 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.2 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  50.66 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  49.26 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  45.11 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  49.26 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  50.7 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.88 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  52.6 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.49 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  46.95 
 
 		 200 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  46.95 
 
 		 200 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.79 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  44 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1635  electron transport complex RsxE subunit  49.13 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  43.69 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  45.5 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  47.91 
 
 		 196 aa  174  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  41.15 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  45.45 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  48.04 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.19 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  44.44 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  44.76 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.96 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.35 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  43.93 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  42.13 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.1 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.45 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  44.81 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.13 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  48.51 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  45.02 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  40.44 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  42.93 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>