More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0092 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
376 aa  773  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  72.87 
 
 
376 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  68.09 
 
 
376 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  67.82 
 
 
376 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  66.76 
 
 
376 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  43.73 
 
 
375 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.2 
 
 
375 aa  337  2e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.71 
 
 
379 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.67 
 
 
380 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.37 
 
 
378 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.79 
 
 
378 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.41 
 
 
378 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.16 
 
 
374 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.95 
 
 
378 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.27 
 
 
378 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.73 
 
 
378 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.25 
 
 
390 aa  287  3e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.16 
 
 
380 aa  283  3e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.16 
 
 
380 aa  282  6e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.02 
 
 
380 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 
376 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 
377 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.67 
 
 
377 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.63 
 
 
377 aa  275  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.77 
 
 
377 aa  275  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
377 aa  275  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.4 
 
 
377 aa  274  1e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.83 
 
 
376 aa  272  5e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.7 
 
 
383 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.07 
 
 
376 aa  269  6e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
383 aa  269  6e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.27 
 
 
377 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.42 
 
 
379 aa  266  6e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.17 
 
 
383 aa  266  6e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.5 
 
 
381 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.02 
 
 
376 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.86 
 
 
380 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.26 
 
 
376 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.26 
 
 
376 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.02 
 
 
376 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.02 
 
 
376 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.98 
 
 
377 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.15 
 
 
383 aa  262  7e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.99 
 
 
376 aa  261  9e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.58 
 
 
377 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.17 
 
 
378 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.12 
 
 
381 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.71 
 
 
376 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.83 
 
 
382 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.19 
 
 
383 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 
376 aa  259  5e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.36 
 
 
376 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.7 
 
 
384 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.79 
 
 
379 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.43 
 
 
376 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.46 
 
 
390 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 
376 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.53 
 
 
377 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
382 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.19 
 
 
387 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.73 
 
 
392 aa  255  1e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.7 
 
 
376 aa  254  2e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.59 
 
 
377 aa  254  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.67 
 
 
379 aa  254  2e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 
379 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 
386 aa  253  4e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.66 
 
 
380 aa  252  8e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  36.36 
 
 
402 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.99 
 
 
391 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
398 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.86 
 
 
386 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.95 
 
 
379 aa  250  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.26 
 
 
379 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  36 
 
 
374 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
401 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
401 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.92 
 
 
401 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.66 
 
 
405 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.66 
 
 
401 aa  245  1e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
405 aa  244  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.66 
 
 
401 aa  245  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
405 aa  244  2e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.61 
 
 
403 aa  244  2e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.9 
 
 
377 aa  244  2e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
399 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
399 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.58 
 
 
406 aa  243  4e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.57 
 
 
399 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.89 
 
 
383 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.77 
 
 
398 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
399 aa  240  3e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.62 
 
 
383 aa  240  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.62 
 
 
383 aa  240  3e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  8.97295e-10 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  37.98 
 
 
374 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.51 
 
 
380 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.62 
 
 
383 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.92021e-11 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.34 
 
 
399 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.07 
 
 
399 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1618  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.22 
 
 
385 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.34 
 
 
383 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  5.16194e-11 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>