69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1253 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  33.78 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  31.84 
 
 
219 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
231 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  30.26 
 
 
213 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  31.56 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  31.42 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  29 
 
 
217 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  31.58 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  29.07 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  29.36 
 
 
202 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  29.36 
 
 
202 aa  85.1  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  29.65 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  27.52 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  30.77 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  26.22 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  27.8 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  30.74 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  28.76 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  30.28 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  22.87 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  26.22 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  25.25 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  27.5 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  23.96 
 
 
454 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  28.65 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  27.11 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  26.19 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  27 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  25.6 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  27.14 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  26.21 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  22.01 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  22.01 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  26.21 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  26.21 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  26.21 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.05 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  26 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  26.21 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  26.24 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  27.23 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  24.67 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  22.98 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  24.88 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  24.41 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  24.05 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  26.55 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  26.4 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  26.09 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  24.67 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  25.57 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  26.26 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  29.46 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  25.56 
 
 
219 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  23.11 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  23.27 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12109  predicted protein  28.44 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  22.58 
 
 
217 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59866  Thiamine pyrophosphokinase (TPK) (Thiamine kinase)  27.33 
 
 
333 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  24.79 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  25.14 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  24.49 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>