More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0499 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  82.98 
 
 		 95 aa  158  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.89 
 
 		 98 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.89 
 
 		 98 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.39 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  63.44 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 97 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 94 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  62.37 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39278  Putative mitochondrial ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176257 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1034  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0754861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  67.07 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  68.24 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1348  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1338  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000532816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  63.04 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0803  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  61.25 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>