More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0046 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  49.24 
 
 		 1231 aa  1211    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.84 
 
 		 1238 aa  1184    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  52.31 
 
 		 1256 aa  1291    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  47.06 
 
 		 1241 aa  1156    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.46 
 
 		 1251 aa  1167    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.58 
 
 		 1293 aa  1186    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  58.07 
 
 		 1252 aa  1413    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.06 
 
 		 1254 aa  1133    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.75 
 
 		 1256 aa  1273    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.21 
 
 		 1244 aa  1175    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.17 
 
 		 1243 aa  1189    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50 
 
 		 1284 aa  1298    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.79 
 
 		 1631 aa  1035    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 		 1236 aa  2516    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.74 
 
 		 1266 aa  1228    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.2 
 
 		 1266 aa  1227    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  47.35 
 
 		 1241 aa  1157    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.33 
 
 		 1251 aa  1181    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  55.24 
 
 		 1244 aa  1380    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.67 
 
 		 962 aa  297  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.58 
 
 		 945 aa  279  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.29 
 
 		 947 aa  275  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.49 
 
 		 953 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.35 
 
 		 953 aa  268  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.73 
 
 		 953 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.71 
 
 		 766 aa  266  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.77 
 
 		 981 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.42 
 
 		 985 aa  253  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29 
 
 		 966 aa  253  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.24 
 
 		 973 aa  246  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.7 
 
 		 959 aa  240  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.88 
 
 		 989 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.88 
 
 		 989 aa  221  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.03 
 
 		 989 aa  218  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.7 
 
 		 995 aa  218  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.09 
 
 		 993 aa  210  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.3 
 
 		 982 aa  208  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.29 
 
 		 996 aa  207  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.92 
 
 		 1222 aa  207  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 		 996 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.37 
 
 		 1217 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.91 
 
 		 993 aa  206  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.03 
 
 		 999 aa  205  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.41 
 
 		 1221 aa  205  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  23.62 
 
 		 1020 aa  205  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  23.99 
 
 		 996 aa  205  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.25 
 
 		 979 aa  205  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  22.64 
 
 		 996 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.67 
 
 		 996 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.32 
 
 		 993 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.39 
 
 		 1301 aa  203  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.85 
 
 		 979 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.2 
 
 		 996 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.79 
 
 		 996 aa  198  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.4 
 
 		 1234 aa  197  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.16 
 
 		 768 aa  197  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.03 
 
 		 1345 aa  197  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.68 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.19 
 
 		 1214 aa  195  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.37 
 
 		 1296 aa  195  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2973  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.87 
 
 		 1222 aa  195  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.48 
 
 		 1295 aa  194  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.48 
 
 		 1306 aa  194  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.28 
 
 		 1223 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.02 
 
 		 800 aa  191  9e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0543  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 		 1294 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164924  normal  0.914439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3203  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.67 
 
 		 1311 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.86 
 
 		 1341 aa  189  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.16 
 
 		 1007 aa  189  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  22.2 
 
 		 1004 aa  189  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.94 
 
 		 1299 aa  188  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.01 
 
 		 993 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.95 
 
 		 1293 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  25 
 
 		 1032 aa  184  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.19 
 
 		 1293 aa  184  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.57 
 
 		 1293 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.85 
 
 		 1293 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0208  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.12 
 
 		 1345 aa  182  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.11 
 
 		 1297 aa  182  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.93 
 
 		 1293 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.06 
 
 		 1313 aa  181  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.78 
 
 		 1295 aa  181  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  25.11 
 
 		 1343 aa  181  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.59 
 
 		 1293 aa  180  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.01 
 
 		 946 aa  180  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.83 
 
 		 1298 aa  179  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.26 
 
 		 1293 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.22 
 
 		 1291 aa  178  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.14 
 
 		 1293 aa  178  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.85 
 
 		 1293 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.35 
 
 		 1293 aa  175  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.48 
 
 		 1293 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.98 
 
 		 1293 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 		 1295 aa  174  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.51 
 
 		 1293 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.89 
 
 		 1307 aa  173  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.23 
 
 		 1293 aa  173  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.47 
 
 		 1293 aa  172  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.7 
 
 		 1293 aa  172  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.68 
 
 		 1298 aa  171  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>