More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3595 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  82.95 
 
 
258 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  78.29 
 
 
258 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  78.29 
 
 
258 aa  427  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  52.92 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
256 aa  258  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_51114  predicted protein  47.33 
 
 
268 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  40.23 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  38.61 
 
 
276 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
254 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
264 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
255 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  40.54 
 
 
254 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
255 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
258 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
257 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
256 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
257 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
255 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.43 
 
 
254 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  38.37 
 
 
241 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
254 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
252 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
255 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
255 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
257 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
254 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  38.46 
 
 
257 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
257 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
247 aa  146  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  38.08 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
248 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.34 
 
 
251 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
257 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
246 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
265 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
253 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
261 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
266 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.86 
 
 
247 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
249 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
293 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
262 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
239 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  35.16 
 
 
255 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
269 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
255 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
270 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
261 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
272 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 
257 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  32.68 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
251 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  32.02 
 
 
259 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
257 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.61 
 
 
254 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 
246 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
250 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.4 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.54 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  37.6 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  34.14 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
264 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
256 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
283 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
256 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.6 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  36.76 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  32.94 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.68 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>