189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5343 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
157 aa  328  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.88 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.61 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  30.3 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.67 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  31.97 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.2 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.37 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 
160 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.78 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  30 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.22 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  29.92 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.4 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  27.21 
 
 
216 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  30.71 
 
 
208 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.67 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  27.61 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0083  flavin reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
205 aa  57.4  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.06 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  24.14 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  24.48 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  32.58 
 
 
430 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  24.46 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.06 
 
 
191 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.38 
 
 
177 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.83 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  27.15 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  24.56 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.9 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  23.66 
 
 
160 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.6 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  22.78 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
236 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  26.53 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.19 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.55 
 
 
192 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.55 
 
 
192 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  24.3 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  26.09 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  25.23 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  24.3 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  24.3 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  28.35 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.53 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4751  flavin reductase domain-containing protein  24.59 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.527565  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.9 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  25.2 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
570 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.87 
 
 
575 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.78 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  28.91 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.26 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.17 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  27.97 
 
 
574 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  28.47 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  26.92 
 
 
244 aa  47.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.47 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.77 
 
 
221 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  29.03 
 
 
174 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
174 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.61 
 
 
155 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
185 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  25.52 
 
 
181 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  27.47 
 
 
172 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  23.7 
 
 
195 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.58 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  24.79 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  23.45 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.7 
 
 
194 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.76 
 
 
178 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  23.68 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  28.93 
 
 
571 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  25.42 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  26.61 
 
 
500 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  23.68 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  23.36 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  27.91 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  23.57 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.66 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  29.13 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.15 
 
 
575 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  22.81 
 
 
209 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>