More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  46.67 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  45.33 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  50.26 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  42.33 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  49.22 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  46.94 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  42.53 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  40.81 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  51.98 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  44.83 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.2 
 
 		 286 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  42.72 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  38.79 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.29 
 
 		 201 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.48 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.01 
 
 		 458 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.77 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  41.28 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.99 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  36.52 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  44.32 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  36.27 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  38.65 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  36.1 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  38.83 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  35.78 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  38.65 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  35.78 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  35.78 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  37.86 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  35.78 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  35.29 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  36.95 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  48 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  35.2 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  37.13 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  37.37 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  35.2 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.97 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  34.18 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  37.95 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  34.69 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  37.93 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  33.65 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  37.5 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.2 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.56 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  38.69 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  38.69 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  38.69 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  37.14 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  39.05 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  37.56 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  35.9 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  37.31 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.84 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  34.8 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  44.57 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  40.96 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  36.76 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36.76 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  37.44 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.91 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  40.19 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  35.44 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.29 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35.47 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  36.53 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  38.86 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  39.46 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  37.32 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  37.32 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  37.32 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  37.57 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  37.32 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  37.32 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  37.62 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  36.27 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  37.32 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  38.67 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  36.27 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>