206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2112 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  99.6 
 
 
253 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.73496e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  100 
 
 
253 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.92224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  94.47 
 
 
253 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  68.4 
 
 
253 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  65.22 
 
 
251 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  67.46 
 
 
263 aa  355  3e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  61.66 
 
 
323 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  63.35 
 
 
274 aa  342  3e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  62.99 
 
 
263 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  2.13835e-06 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  61.26 
 
 
262 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  62.99 
 
 
263 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  60.87 
 
 
262 aa  337  1e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  60.87 
 
 
262 aa  336  2e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  60.63 
 
 
264 aa  326  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.03 
 
 
254 aa  325  4e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  57.31 
 
 
263 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  57.42 
 
 
265 aa  313  2e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  2.77159e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  55.73 
 
 
263 aa  312  3e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  57.81 
 
 
264 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  52.51 
 
 
225 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  42.41 
 
 
262 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.91 
 
 
321 aa  213  2e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.96 
 
 
268 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  41.57 
 
 
268 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  41.57 
 
 
268 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  40.78 
 
 
268 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  40.78 
 
 
268 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  37.4 
 
 
259 aa  182  4e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  39.83 
 
 
291 aa  171  8e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  34.51 
 
 
271 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  41.08 
 
 
251 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  36.33 
 
 
251 aa  147  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.0943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.2 
 
 
263 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.64 
 
 
296 aa  131  1e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.64 
 
 
296 aa  131  1e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  33.18 
 
 
296 aa  128  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.27 
 
 
284 aa  121  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.19 
 
 
271 aa  120  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.04 
 
 
673 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.31 
 
 
291 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.11 
 
 
277 aa  114  2e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  31.76 
 
 
296 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.15 
 
 
284 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  30.04 
 
 
279 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  27.24 
 
 
275 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  35.71 
 
 
273 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.5 
 
 
704 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  33.53 
 
 
163 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  30.8 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.55 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.96 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  29.22 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  5.56419e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  29.22 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  32.62 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.31718e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  24.71 
 
 
638 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.57 
 
 
288 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  27.92 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25 
 
 
310 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.42 
 
 
294 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  28.15 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  29.51 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  26.55 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.07 
 
 
303 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
297 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  27.05 
 
 
280 aa  84.7  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30 
 
 
275 aa  84  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.46 
 
 
348 aa  84  2e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  26.01 
 
 
277 aa  84.3  2e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4407  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.2 
 
 
283 aa  82.8  4e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.167881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  27.8 
 
 
279 aa  82.8  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  27.8 
 
 
279 aa  82.8  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  81.3  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.77 
 
 
286 aa  81.6  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1787  hypothetical protein  40.43 
 
 
93 aa  80.9  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.95 
 
 
301 aa  80.1  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  80.5  3e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  30.69 
 
 
280 aa  80.5  3e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  25.46 
 
 
274 aa  79  8e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.87 
 
 
286 aa  78.6  8e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  33.33 
 
 
286 aa  78.2  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.47 
 
 
530 aa  78.2  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25 
 
 
279 aa  78.6  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1973  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1246  hypothetical protein  55.56 
 
 
87 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.19 
 
 
274 aa  77.8  2e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  24.16 
 
 
279 aa  77.8  2e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2345  hypothetical protein  53.97 
 
 
73 aa  77  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2500  hypothetical protein  53.97 
 
 
87 aa  76.3  4e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  29.13 
 
 
307 aa  76.3  5e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  25.93 
 
 
288 aa  76.3  5e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  24.77 
 
 
307 aa  74.7  1e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  25.36 
 
 
289 aa  75.1  1e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  25.37 
 
 
279 aa  74.3  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  23.27 
 
 
279 aa  73.9  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  23.05 
 
 
279 aa  74.3  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  23.27 
 
 
279 aa  73.6  3e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  25.8 
 
 
294 aa  73.6  3e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  23.27 
 
 
279 aa  73.6  3e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2028  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  23.9 
 
 
292 aa  73.6  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  23.27 
 
 
279 aa  73.6  3e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>