More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  34.52 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  32.14 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  28.44 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  35.68 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  31.88 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  30.43 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  31.35 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  27.94 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  30.97 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  30.69 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  30.69 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  32.9 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  31.55 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  29.61 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  30.4 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  28.21 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  27.78 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  31.33 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  31.33 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  32.33 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.9 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  34.33 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  35.66 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  32.5 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  30.98 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  30.69 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  30.3 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  34.07 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  30.69 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  33.33 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.23 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  29.13 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  32.28 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  30.18 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.25 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  27.36 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0191  peptidase C26  33.86 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  29.67 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  29.95 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  30.14 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  29.19 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  29.02 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  27.15 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  30.22 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  33.12 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  28.97 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  34.25 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  30.93 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  30 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  29.89 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  31.33 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  31.18 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  34.25 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1237  peptidase C26  32.56 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  26.9 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  31.38 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  30.2 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.27 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  30.91 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  31.06 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  28.21 
 
 		 259 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  29.28 
 
 		 268 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  31.29 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  28.21 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  29.61 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  27.27 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  23.59 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  28.35 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  31.19 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7781  peptidase C26  28.18 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  29.69 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0121  peptidase C26  31.58 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  31.43 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  30.1 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  28.57 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  31.54 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  28.57 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  28.57 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  29.28 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  31.39 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1620  glutamine amidotransferase-like  35.04 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000108554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  28.57 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  32.17 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  31.94 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  33.57 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  28.83 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  29.02 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  32.52 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2620  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  29.02 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  29.08 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  31.54 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  26.87 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>