263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7781 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7781  peptidase C26  100 
 
 
274 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  39.08 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  39.08 
 
 
268 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  39.08 
 
 
279 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  39.08 
 
 
279 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  38.7 
 
 
268 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  37.93 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  37.55 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  36.09 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  38.22 
 
 
255 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  35.5 
 
 
313 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  36.12 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  35.23 
 
 
254 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  36.12 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  37.11 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  36.26 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
264 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  37.15 
 
 
261 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  35.74 
 
 
255 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  35.88 
 
 
250 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  34.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.46 
 
 
250 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  34.46 
 
 
254 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  34.46 
 
 
254 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  37.71 
 
 
253 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  36.76 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  36.23 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  36.76 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.33 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  33.84 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  38.33 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  33.84 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  33.84 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  34.36 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  35.96 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  37.02 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  34.88 
 
 
274 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  34.88 
 
 
253 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  35.71 
 
 
279 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.78 
 
 
253 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  32.18 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  35.94 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  33.46 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  36.12 
 
 
266 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  36.12 
 
 
266 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  34.38 
 
 
269 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  36.12 
 
 
266 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  33.98 
 
 
269 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  35.91 
 
 
253 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  33.98 
 
 
269 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  33.21 
 
 
259 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  33.2 
 
 
253 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  33.2 
 
 
253 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.38 
 
 
269 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.15 
 
 
255 aa  141  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  33.73 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  35.93 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.21 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  33.2 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  31.89 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  34.72 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  36.54 
 
 
257 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  37.25 
 
 
253 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  36.06 
 
 
257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  36.64 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  34.43 
 
 
301 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  36.02 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  31.36 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  31.03 
 
 
259 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  36.06 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  36.26 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  36.05 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  36.26 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  36.26 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  36.54 
 
 
249 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  33.06 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  36.29 
 
 
349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  35.88 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  33.75 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  31.51 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  37.69 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  36.29 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.95 
 
 
255 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  33.95 
 
 
259 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  32.5 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1649  peptidase C26  32.22 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  31.09 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  32.5 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  34.73 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  32.2 
 
 
275 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  36.55 
 
 
263 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  31.02 
 
 
256 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  36.87 
 
 
250 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  32.86 
 
 
276 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  32.56 
 
 
263 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  33.01 
 
 
281 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  33.01 
 
 
281 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>