More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  854    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.66 
 
 
389 aa  292  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.6 
 
 
391 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  38.04 
 
 
394 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.13 
 
 
390 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.54 
 
 
399 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.19 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.04 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2455  amidohydrolase  40 
 
 
382 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.6 
 
 
387 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.21 
 
 
401 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.47 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.83 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.21 
 
 
391 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.92 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.69 
 
 
391 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  36.62 
 
 
391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.87 
 
 
403 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.63 
 
 
393 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.51 
 
 
393 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  36.88 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.84 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.95 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.62 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.62 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  37.21 
 
 
391 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.92 
 
 
405 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.61 
 
 
394 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  39.11 
 
 
443 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  35.77 
 
 
391 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1023  amidohydrolase  35.88 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00286285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.81 
 
 
392 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.85 
 
 
397 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  37.24 
 
 
398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.99 
 
 
398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  36.14 
 
 
390 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.94 
 
 
403 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  39.39 
 
 
400 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  37.82 
 
 
389 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  36.27 
 
 
392 aa  263  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.79 
 
 
391 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.59 
 
 
400 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  36.96 
 
 
449 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.56 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  37.56 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.5 
 
 
405 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  41.36 
 
 
398 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.31 
 
 
389 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  36.36 
 
 
390 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.64 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.46 
 
 
389 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  37.56 
 
 
389 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.14 
 
 
391 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.31 
 
 
389 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.9 
 
 
405 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  40.72 
 
 
394 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  38.12 
 
 
395 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  36.79 
 
 
392 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.78 
 
 
395 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  37.82 
 
 
389 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  37.75 
 
 
407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  38.69 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  37.22 
 
 
393 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.03 
 
 
396 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  35.53 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  37.14 
 
 
389 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  42.67 
 
 
398 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.46 
 
 
430 aa  252  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  35.85 
 
 
459 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  36.63 
 
 
400 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.66 
 
 
395 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  38.05 
 
 
404 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.36 
 
 
480 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  37.86 
 
 
437 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  38.85 
 
 
404 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.7 
 
 
386 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  35.79 
 
 
398 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  35.79 
 
 
398 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  38.66 
 
 
398 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  34.93 
 
 
423 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  36.65 
 
 
396 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  35.62 
 
 
395 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  35.87 
 
 
407 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  39.84 
 
 
403 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.13 
 
 
400 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.71 
 
 
465 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.71 
 
 
465 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  37.56 
 
 
407 aa  247  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  38.83 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37.25 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  38.48 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  35.86 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  35.6 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  36.98 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.91 
 
 
438 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  35 
 
 
402 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  36.29 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>