134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3915 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  877    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  49.77 
 
 
452 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  50.11 
 
 
454 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  46.43 
 
 
459 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  48.07 
 
 
486 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  50.11 
 
 
452 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  48.42 
 
 
458 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  44.27 
 
 
443 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  50.57 
 
 
458 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  42.31 
 
 
412 aa  347  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  47.99 
 
 
439 aa  335  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  42.48 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  43.02 
 
 
417 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  47.98 
 
 
453 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  43.02 
 
 
417 aa  309  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  44.5 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  48.27 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  47.65 
 
 
454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  42.82 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  48.48 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 
448 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  43.99 
 
 
432 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  43.31 
 
 
424 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  43.45 
 
 
422 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  46.67 
 
 
420 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  47.11 
 
 
443 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  45.92 
 
 
420 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  42.89 
 
 
424 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 
432 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  42.08 
 
 
496 aa  292  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  46.8 
 
 
421 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  40.19 
 
 
415 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  43.85 
 
 
419 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  46.65 
 
 
440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  43.48 
 
 
429 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  45.13 
 
 
428 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  41.59 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  44.87 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  46.72 
 
 
439 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  44.62 
 
 
424 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  45.06 
 
 
432 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  44.62 
 
 
424 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  47.39 
 
 
440 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  46.72 
 
 
439 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  42.5 
 
 
432 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  43 
 
 
426 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  44.36 
 
 
424 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  43.67 
 
 
438 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 
448 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  45.43 
 
 
432 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  44.39 
 
 
404 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  47.15 
 
 
440 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  43.19 
 
 
426 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  44.67 
 
 
446 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  41.96 
 
 
442 aa  276  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  43.48 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  43.92 
 
 
421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  49.86 
 
 
422 aa  272  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  41.61 
 
 
447 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  46.77 
 
 
437 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  46.98 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  43.92 
 
 
421 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  42.63 
 
 
423 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  43.94 
 
 
437 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  46.52 
 
 
437 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  47.01 
 
 
434 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  41.7 
 
 
504 aa  266  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  46.38 
 
 
434 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  47.69 
 
 
424 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  39.53 
 
 
442 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  46.96 
 
 
422 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  40.65 
 
 
450 aa  262  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  43.51 
 
 
451 aa  262  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  46.85 
 
 
421 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  46.42 
 
 
422 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  40.27 
 
 
418 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  46.93 
 
 
460 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  37.72 
 
 
445 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  42.56 
 
 
441 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  45.18 
 
 
424 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 
439 aa  256  7e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  46.02 
 
 
437 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  37.82 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  41.92 
 
 
411 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  43.46 
 
 
374 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  44.35 
 
 
419 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  43.8 
 
 
435 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  44.74 
 
 
440 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  43.6 
 
 
439 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  44.14 
 
 
428 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  45.13 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  44.03 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  41.27 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  41.98 
 
 
443 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  44.57 
 
 
426 aa  242  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  44.51 
 
 
424 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  42.64 
 
 
444 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  43.8 
 
 
427 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  36.81 
 
 
410 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  43.22 
 
 
407 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>