250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3237 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  74.16 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  74.24 
 
 		 273 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  74.81 
 
 		 273 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  74.24 
 
 		 273 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  72.56 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  75.2 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  75.59 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  77.5 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  75.42 
 
 		 230 aa  355  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  66.8 
 
 		 238 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  65.81 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  56.38 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  58.11 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  57.66 
 
 		 236 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  54.43 
 
 		 239 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  53.16 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  55.26 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  53.78 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  53.98 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  52.89 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  52.89 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  54.87 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  46.46 
 
 		 242 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  43.78 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  42.31 
 
 		 244 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  41.45 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  42.6 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  37.77 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  36.82 
 
 		 244 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.5 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.68 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  34.47 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  37.24 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.35 
 
 		 250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  36.98 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  31.84 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  30.31 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  40.86 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  40.54 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  37 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  37 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.4 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.77 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  40.22 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  33.78 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.22 
 
 		 228 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  35.62 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.62 
 
 		 233 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  34.22 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.74 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.89 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  35.16 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.64 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  33.33 
 
 		 229 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.96 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  27.94 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  29.17 
 
 		 235 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  29.17 
 
 		 235 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  33.48 
 
 		 241 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  33.03 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  33.03 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  33.03 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  32.58 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.31 
 
 		 241 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  32.56 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  33.01 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.98 
 
 		 235 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  32.39 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.53 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  32.13 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  31.92 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  26.45 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.53 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  30.18 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  28.88 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  35.16 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  28.19 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.79 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  31.09 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.79 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.56 
 
 		 240 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  35.22 
 
 		 230 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  31.52 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  28.38 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  26.64 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.78 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.19 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  26.46 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  28.57 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  30.46 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  30.68 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  27.71 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  30.61 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  33.87 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.1 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  30.89 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.33 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  27.97 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  33.75 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>