More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4216 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  96.88 
 
 
321 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  96.26 
 
 
321 aa  574  1e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  88.16 
 
 
322 aa  563  1e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  88.47 
 
 
322 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  90.97 
 
 
321 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  86.29 
 
 
322 aa  538  1e-152  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  86.52 
 
 
322 aa  538  1e-152  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  74.76 
 
 
327 aa  458  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  74.29 
 
 
327 aa  458  1e-128  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  73.04 
 
 
322 aa  453  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  72.58 
 
 
323 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  69.28 
 
 
324 aa  431  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  69.57 
 
 
324 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  54.69 
 
 
311 aa  318  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  54.69 
 
 
311 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  54.37 
 
 
311 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  54.37 
 
 
311 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  54.69 
 
 
311 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  54.37 
 
 
311 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  54.37 
 
 
311 aa  315  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  54.37 
 
 
311 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  54.37 
 
 
311 aa  315  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  54.05 
 
 
311 aa  315  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  54.05 
 
 
311 aa  314  1e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  53.9 
 
 
311 aa  298  7e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  52.13 
 
 
310 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  52.65 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  54.37 
 
 
314 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  49.52 
 
 
350 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  49.36 
 
 
334 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  48 
 
 
330 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  48 
 
 
330 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  48 
 
 
330 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  47.54 
 
 
309 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  48.87 
 
 
306 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  52.77 
 
 
325 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  50 
 
 
334 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  50 
 
 
334 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  53.85 
 
 
309 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  53.95 
 
 
835 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  46 
 
 
312 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  53.64 
 
 
310 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  53.64 
 
 
310 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  53.36 
 
 
313 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  49.31 
 
 
334 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  48.99 
 
 
334 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  48.99 
 
 
342 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  48.99 
 
 
342 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  48.02 
 
 
338 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  51.45 
 
 
314 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  50.98 
 
 
318 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  50.51 
 
 
345 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  50 
 
 
342 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  49.33 
 
 
335 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  49.33 
 
 
336 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  49.67 
 
 
335 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  49.33 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  49.33 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  48 
 
 
333 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  48.6 
 
 
322 aa  244  1e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
314 aa  244  1e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  48.67 
 
 
337 aa  243  2e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
337 aa  243  4e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
315 aa  242  8e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  40.54 
 
 
355 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 
348 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  45.74 
 
 
331 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  45.34 
 
 
346 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  49.33 
 
 
325 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  44.16 
 
 
320 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.13624e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  45.74 
 
 
347 aa  236  5e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  45.74 
 
 
345 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  49.51 
 
 
325 aa  234  2e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
336 aa  233  2e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  43.65 
 
 
328 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 
346 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.43 
 
 
345 aa  233  4e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  48.51 
 
 
298 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  48.51 
 
 
294 aa  232  7e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  48.51 
 
 
294 aa  232  7e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  48.84 
 
 
279 aa  232  8e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
355 aa  231  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
383 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  46.03 
 
 
342 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  43.35 
 
 
350 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  47.57 
 
 
316 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>