More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0308 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
246 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
246 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
246 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
246 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  99.19 
 
 
246 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  93.09 
 
 
246 aa  487  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  93.5 
 
 
246 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  93.09 
 
 
246 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  93.42 
 
 
243 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  87.8 
 
 
245 aa  452  1e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  79.92 
 
 
245 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  79.1 
 
 
245 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  78.6 
 
 
244 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  76.03 
 
 
254 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  76.03 
 
 
254 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  76.03 
 
 
254 aa  405  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  74.79 
 
 
246 aa  398  1e-110  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2838  DNA polymerase III subunit epsilon  75.72 
 
 
244 aa  400  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  60.57 
 
 
247 aa  306  2e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2398  DNA polymerase III subunit epsilon  60.57 
 
 
243 aa  302  3e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002773  DNA polymerase III epsilon subunit  61.48 
 
 
240 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.26 
 
 
240 aa  296  2e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  59.24 
 
 
239 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.90412e-06  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  61.44 
 
 
238 aa  295  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  60.25 
 
 
252 aa  292  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  59.41 
 
 
239 aa  291  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.09 
 
 
242 aa  282  4e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.47 
 
 
253 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.12 
 
 
235 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.69 
 
 
242 aa  275  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.97972e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2111  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.28 
 
 
242 aa  275  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.49377e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.87 
 
 
242 aa  273  2e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.72168e-07  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  53.88 
 
 
242 aa  273  2e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.33992e-07  hitchhiker  1.48516e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.87 
 
 
242 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.77394e-07  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.87 
 
 
242 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.79182e-06  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.47 
 
 
242 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.8711e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.87 
 
 
242 aa  271  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.47 
 
 
242 aa  271  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.77217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.85 
 
 
242 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.47945e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2063  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.85 
 
 
242 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.71549e-05  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.85 
 
 
242 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.917e-05  hitchhiker  9.04617e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.85 
 
 
242 aa  265  6e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.79357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  55.88 
 
 
242 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.14 
 
 
237 aa  264  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.72 
 
 
237 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  55.04 
 
 
244 aa  261  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.04 
 
 
242 aa  261  9e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.88 
 
 
243 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.74 
 
 
235 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  56.38 
 
 
252 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  56.38 
 
 
252 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.32 
 
 
236 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  55.14 
 
 
254 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.01 
 
 
238 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.78 
 
 
243 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  53.36 
 
 
244 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  53.78 
 
 
244 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  55.79 
 
 
252 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.21 
 
 
257 aa  254  1e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  54.2 
 
 
244 aa  253  1e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  54.58 
 
 
246 aa  252  4e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  54.17 
 
 
246 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  53.78 
 
 
244 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  51.64 
 
 
252 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.59 
 
 
231 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
241 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  53.78 
 
 
244 aa  248  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  52.87 
 
 
259 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.72 
 
 
243 aa  248  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  53.36 
 
 
244 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.36585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  53.36 
 
 
249 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  54.32 
 
 
252 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
240 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
240 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.64 
 
 
267 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  52.94 
 
 
253 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  53.78 
 
 
244 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  53.78 
 
 
244 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.75 
 
 
238 aa  244  1e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.16 
 
 
234 aa  243  2e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  53.36 
 
 
244 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.03 
 
 
243 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  51.27 
 
 
233 aa  239  3e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  51.27 
 
 
233 aa  239  3e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.9 
 
 
239 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  52.74 
 
 
238 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.16 
 
 
231 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.26 
 
 
234 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.63 
 
 
240 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.63 
 
 
237 aa  231  8e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.72 
 
 
232 aa  230  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>