275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1032 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 348 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  61.09 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  59.42 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  57.57 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  58.12 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  56.96 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  58.82 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  57.79 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  57.33 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  55.99 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  57.1 
 
 		 330 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  56.05 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  65.22 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  52.66 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  57.24 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  52.98 
 
 		 330 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.381097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  55.66 
 
 		 306 aa  243  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  55.87 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  55.87 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  55.66 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  56.6 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  56.13 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  55.61 
 
 		 322 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  54.46 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  54.21 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  57.5 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  53.99 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  56.5 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  53.7 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  54.46 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 369 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  50.94 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  49.07 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  46.79 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  44.95 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  47.34 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  45.1 
 
 		 418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.59 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.63 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  45.59 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.04 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  44.61 
 
 		 413 aa  175  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 404 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 415 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  44.12 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  45.54 
 
 		 240 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  43.54 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  49.02 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.54 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.63 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.28 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.33 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  42.6 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 421 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  44.34 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  41.58 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>