More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1014 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  100 
 
 
403 aa  814  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  67.58 
 
 
403 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  67.58 
 
 
403 aa  559  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  67.33 
 
 
403 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  67.66 
 
 
403 aa  555  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  65.34 
 
 
403 aa  541  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  70.57 
 
 
403 aa  538  1e-152  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  68.58 
 
 
537 aa  524  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  69.08 
 
 
403 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  61.71 
 
 
400 aa  506  1e-142  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  45.02 
 
 
403 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.37 
 
 
405 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.85 
 
 
402 aa  357  3e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  47.73 
 
 
403 aa  355  8e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  45.02 
 
 
403 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  45.27 
 
 
403 aa  353  3e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.89 
 
 
402 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  44.58 
 
 
403 aa  345  6e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  45.77 
 
 
403 aa  345  9e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.64 
 
 
402 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.25 
 
 
403 aa  338  7e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  45.34 
 
 
401 aa  337  2e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  50.63 
 
 
413 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.09 
 
 
402 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  44.59 
 
 
395 aa  327  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  44.72 
 
 
399 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  44.84 
 
 
403 aa  321  1e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  47.75 
 
 
401 aa  321  1e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  47.75 
 
 
401 aa  321  1e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  43.25 
 
 
406 aa  318  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.58 
 
 
403 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.53 
 
 
400 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.88 
 
 
402 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  44.36 
 
 
404 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.63 
 
 
409 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  43.07 
 
 
400 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  44.05 
 
 
408 aa  312  5e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  46 
 
 
402 aa  313  5e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.73 
 
 
410 aa  306  5e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.5 
 
 
412 aa  305  9e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44 
 
 
412 aa  305  9e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  42.11 
 
 
401 aa  302  8e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  43.18 
 
 
406 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  43.94 
 
 
402 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.57 
 
 
403 aa  298  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  45.29 
 
 
402 aa  298  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  49.05 
 
 
402 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.56 
 
 
412 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  44.81 
 
 
402 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  41.81 
 
 
415 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  44.75 
 
 
402 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  44.3 
 
 
399 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  44.3 
 
 
399 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  44.24 
 
 
412 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  44.5 
 
 
402 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.86 
 
 
401 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  44.14 
 
 
411 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  45.84 
 
 
402 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.92 
 
 
403 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.17 
 
 
402 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  43.98 
 
 
421 aa  290  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  48.25 
 
 
404 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  44.31 
 
 
443 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.42 
 
 
407 aa  285  1e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  42.24 
 
 
400 aa  285  1e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  44.33 
 
 
415 aa  284  2e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.56 
 
 
406 aa  283  4e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  43.92 
 
 
408 aa  283  4e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.36 
 
 
410 aa  283  4e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  39.75 
 
 
507 aa  282  7e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  43.7 
 
 
402 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  41.33 
 
 
418 aa  272  8e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  40.95 
 
 
411 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.95 
 
 
416 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  41.92 
 
 
416 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  42.21 
 
 
415 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  40.2 
 
 
404 aa  270  3e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.5 
 
 
408 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  40.71 
 
 
404 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.2 
 
 
414 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  38.35 
 
 
404 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  37.63 
 
 
526 aa  263  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  39.74 
 
 
565 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  40.94 
 
 
423 aa  262  9e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.06 
 
 
403 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  39.55 
 
 
421 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  40.15 
 
 
504 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.25 
 
 
402 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  42.68 
 
 
403 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  41.1 
 
 
422 aa  259  5e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.59 
 
 
415 aa  259  5e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.75 
 
 
514 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  42.04 
 
 
405 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  41.24 
 
 
415 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  39.95 
 
 
411 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  39.65 
 
 
412 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  42.94 
 
 
549 aa  254  1e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  40.86 
 
 
403 aa  255  1e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.85 
 
 
506 aa  255  1e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.85 
 
 
506 aa  255  1e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>