183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0749 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
295 aa  615  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1033  phosphatidylserine decarboxylase  47.58 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.339305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1320  phosphatidylserine decarboxylase  46.92 
 
 
267 aa  249  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00632979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1554  phosphatidylserine decarboxylase  47.39 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1384  phosphatidylserine decarboxylase  44.57 
 
 
266 aa  225  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0934  phosphatidylserine decarboxylase  46.07 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0863  phosphatidylserine decarboxylase  46.07 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  42.86 
 
 
269 aa  215  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0997  phosphatidylserine decarboxylase  44.94 
 
 
266 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1154  phosphatidylserine decarboxylase  41.06 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0928124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  35.69 
 
 
292 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  36.43 
 
 
292 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 
282 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
289 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  35.69 
 
 
292 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  36 
 
 
292 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  33.96 
 
 
282 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  36 
 
 
292 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  36.07 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  36.07 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  35.06 
 
 
286 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  35.22 
 
 
283 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  34.66 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  35.38 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  32.81 
 
 
282 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  36.24 
 
 
289 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  35.77 
 
 
287 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  34.55 
 
 
287 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  35.57 
 
 
288 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  32.79 
 
 
294 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 
285 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  33.21 
 
 
282 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  35.84 
 
 
284 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  35.59 
 
 
306 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  32.66 
 
 
289 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  32.83 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  32.85 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  34.51 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  32.41 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  36.64 
 
 
289 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  35.57 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  36.26 
 
 
325 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
286 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  35.39 
 
 
302 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  35.39 
 
 
288 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  33.57 
 
 
287 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  32.03 
 
 
293 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  32.03 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  32.45 
 
 
307 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  31.87 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  33.21 
 
 
345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  33.87 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  33.07 
 
 
303 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  34.26 
 
 
284 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.87 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  35.43 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  35.43 
 
 
280 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  30.42 
 
 
289 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  32.1 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  34.14 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  32.13 
 
 
284 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  31.73 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  32.03 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  33.6 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  32.45 
 
 
288 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  32.94 
 
 
293 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  32.35 
 
 
293 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  32.35 
 
 
293 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  35.36 
 
 
293 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  32.35 
 
 
293 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 
297 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  31.4 
 
 
285 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 
297 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  32.55 
 
 
293 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  30.86 
 
 
285 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.37 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  33.91 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  31.87 
 
 
610 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 
613 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  33.47 
 
 
289 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  32.57 
 
 
303 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  33.47 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  33.04 
 
 
259 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  31.99 
 
 
304 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>