238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1210 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  66.02 
 
 		 469 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  65.81 
 
 		 469 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  66.45 
 
 		 469 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  66.02 
 
 		 469 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  67.1 
 
 		 469 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  65.16 
 
 		 469 aa  634    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  67.1 
 
 		 469 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  66.02 
 
 		 469 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  100 
 
 		 465 aa  964    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  66.45 
 
 		 469 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  66.02 
 
 		 469 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  66.74 
 
 		 461 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  66.96 
 
 		 466 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  66.67 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  62.39 
 
 		 462 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  56.74 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  55.87 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  55.87 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  56.67 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  53.98 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  54.35 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  55.58 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  54.74 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  55.04 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  55.12 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  55.26 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  54.95 
 
 		 461 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  54.74 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  54.76 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  54 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  53.26 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  53.23 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  51.72 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  54.1 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  53.61 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  53.88 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  51.63 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  51.84 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  51.75 
 
 		 473 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  51.41 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  51.62 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  50.76 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  50.22 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  54.43 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  51.64 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  51.18 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  51.95 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  53.21 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  49.89 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  50.11 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  52.98 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  49.78 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  49.13 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  48.69 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  51.18 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  49.67 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  48.57 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  49.01 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  51.64 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  48.81 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  49.89 
 
 		 461 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  52.36 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  52.12 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  46.2 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  46.98 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  43.22 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  42.83 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  42.98 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  43.82 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  43.14 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0662  threonine synthase  43.03 
 
 		 462 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  42.52 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0696  threonine synthase  43.03 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  42.95 
 
 		 480 aa  359  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  41.88 
 
 		 475 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  41.88 
 
 		 475 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  43.03 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  42.77 
 
 		 482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  45.28 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  41.89 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  42.09 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  42.51 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  43.15 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  42.94 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  42.95 
 
 		 477 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  41.88 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  41.88 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  41.8 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  42.74 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  41.89 
 
 		 483 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  41.6 
 
 		 483 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  41.77 
 
 		 470 aa  342  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  41.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  41.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  41.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  41.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  41.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>