229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0696 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0662  threonine synthase  99.57 
 
 		 462 aa  939    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0696  threonine synthase  100 
 
 		 462 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  43.6 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  46.27 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  45.5 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  45.27 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  42.98 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  44.8 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  42.98 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  42.3 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  45.06 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  46.51 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  42.52 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  43.76 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  43.03 
 
 		 465 aa  362  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  42.65 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  39.87 
 
 		 462 aa  339  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.65 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  41.59 
 
 		 462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  41.2 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  37.82 
 
 		 463 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  40.24 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  39.53 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  38.8 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  41.12 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  38.8 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  37.82 
 
 		 463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  37.59 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  39.9 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  39.66 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  39.9 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  39.42 
 
 		 461 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  37.93 
 
 		 468 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  38.7 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  39.62 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  37.41 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  37.65 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  39.04 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  38.55 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.85 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  36.78 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  36.78 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  34.8 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  38.46 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  37.74 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  37.5 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  36.96 
 
 		 460 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  39.29 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  38.11 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  37.02 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  37.89 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  38.39 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  38.62 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  38.14 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  41.6 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  35.47 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  34.8 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  34.47 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  38.46 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  34.8 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  35.64 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  35.02 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  34.03 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  34.49 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.89 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  35.58 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  35.82 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  35.17 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  32.55 
 
 		 511 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  36.76 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  32.17 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  33.8 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  32.96 
 
 		 475 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  32.96 
 
 		 475 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  33.1 
 
 		 473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  32.22 
 
 		 475 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  32.89 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  34.43 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  33.5 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  34.14 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  34.53 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  34.14 
 
 		 481 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  33.77 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  33.26 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  31.25 
 
 		 517 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  34.06 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  34.97 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  33.56 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  33.63 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  33.63 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  34.4 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  33.04 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  33.78 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  32.26 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>