More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1859 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
154 aa  320  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  1.32431e-09 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  99.35 
 
 
154 aa  318  1e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  99.35 
 
 
154 aa  318  1e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  98.05 
 
 
154 aa  314  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  86.39 
 
 
143 aa  259  9e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  86.39 
 
 
143 aa  259  9e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  1.26289e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  86.39 
 
 
143 aa  259  9e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  85.71 
 
 
143 aa  256  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  88.57 
 
 
143 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  87.41 
 
 
141 aa  247  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  86.76 
 
 
142 aa  244  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  81.12 
 
 
145 aa  241  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  87.02 
 
 
149 aa  241  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  84.96 
 
 
141 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  86.82 
 
 
141 aa  236  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  8.72149e-05  hitchhiker  9.25313e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  81.02 
 
 
142 aa  228  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
135 aa  179  9e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
135 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
135 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  65.08 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  65.08 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  65.87 
 
 
135 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  63.91 
 
 
143 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 
129 aa  172  2e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  62.41 
 
 
137 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  60.16 
 
 
136 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 
127 aa  163  7e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
131 aa  162  1e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
132 aa  156  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  54.69 
 
 
132 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 
131 aa  146  1e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
131 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
139 aa  135  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
133 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  48.25 
 
 
120 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  48.25 
 
 
120 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  50.89 
 
 
263 aa  112  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
131 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 
131 aa  110  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
143 aa  109  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 
136 aa  108  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
141 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
265 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
260 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58727e-07 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
165 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  4.50993e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.5 
 
 
176 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  38.66 
 
 
176 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  38.66 
 
 
176 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
171 aa  87  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  43.86 
 
 
168 aa  87  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.67 
 
 
168 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.67 
 
 
171 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
171 aa  87  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.67 
 
 
168 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.67 
 
 
168 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.83 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.83 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.83 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  40.37 
 
 
169 aa  82.4  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
168 aa  82.4  2e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  40.37 
 
 
170 aa  82.4  2e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
147 aa  82  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
160 aa  81.6  3e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
168 aa  80.9  6e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
164 aa  80.5  7e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
133 aa  80.5  7e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
172 aa  79.7  1e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
174 aa  79  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
175 aa  79.3  2e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.64 
 
 
161 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
161 aa  78.2  4e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  35.14 
 
 
166 aa  77  9e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
164 aa  77  9e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
175 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  31.53 
 
 
188 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.14 
 
 
166 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.82 
 
 
159 aa  76.6  1e-13  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  33.33 
 
 
157 aa  76.3  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
141 aa  76.3  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
160 aa  76.6  1e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.05 
 
 
118 aa  76.6  1e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  34.71 
 
 
185 aa  75.9  2e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
185 aa  76.3  2e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  31.53 
 
 
160 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 
170 aa  75.9  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
144 aa  75.5  2e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  32.84 
 
 
173 aa  75.5  2e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
163 aa  75.5  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
144 aa  75.5  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
146 aa  75.1  3e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
178 aa  75.5  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
170 aa  75.1  3e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
178 aa  75.5  3e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
161 aa  75.1  3e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 
170 aa  75.1  4e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>