More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0103 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
326 aa  671  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  8.22794e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
326 aa  671  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.35752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  54.55 
 
 
341 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.43 
 
 
336 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  56.83 
 
 
338 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.27 
 
 
333 aa  338  1e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  42.26 
 
 
340 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  43.23 
 
 
325 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  42.02 
 
 
340 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  41.75 
 
 
338 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  40.34 
 
 
707 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  41.94 
 
 
322 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.66 
 
 
685 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.47 
 
 
364 aa  222  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  38.54 
 
 
333 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.15 
 
 
330 aa  214  2e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.44 
 
 
330 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  35.85 
 
 
461 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.73 
 
 
363 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  36.89 
 
 
372 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  36.67 
 
 
306 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37 
 
 
302 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  37.22 
 
 
315 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.02 
 
 
325 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.88 
 
 
352 aa  185  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.56 
 
 
393 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.16 
 
 
459 aa  182  5e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  35.4 
 
 
332 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  37.29 
 
 
315 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  37.12 
 
 
300 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.53191e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  35.87 
 
 
326 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  33.44 
 
 
325 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  35.45 
 
 
302 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.92 
 
 
346 aa  179  5e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  35.96 
 
 
315 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.84 
 
 
333 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  37.58 
 
 
291 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  36.36 
 
 
315 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  35.65 
 
 
315 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  36.12 
 
 
300 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  3.3727e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  35.16 
 
 
312 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  36.88 
 
 
308 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  37.33 
 
 
304 aa  175  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.11 
 
 
371 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  32.72 
 
 
324 aa  175  1e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  37.74 
 
 
315 aa  175  1e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  34.81 
 
 
334 aa  175  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.29 
 
 
465 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.22 
 
 
371 aa  174  2e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.11 
 
 
328 aa  174  2e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.22 
 
 
371 aa  174  2e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.25 
 
 
315 aa  173  3e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.33 
 
 
307 aa  173  3e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  34.34 
 
 
298 aa  173  4e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  36.07 
 
 
316 aa  173  4e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  35.88 
 
 
771 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  36.18 
 
 
310 aa  172  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.33483e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.1 
 
 
319 aa  172  6e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  33.11 
 
 
372 aa  172  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  31.42 
 
 
345 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  34.19 
 
 
459 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  34.81 
 
 
316 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  36.18 
 
 
315 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  6.72149e-06 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  34.81 
 
 
316 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  35.91 
 
 
294 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  34.19 
 
 
312 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  35.91 
 
 
294 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  36.91 
 
 
290 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  34.26 
 
 
326 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  33.88 
 
 
304 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  35.13 
 
 
773 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 
302 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  36.54 
 
 
290 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  37.21 
 
 
294 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  35.62 
 
 
318 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  34.67 
 
 
306 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.92 
 
 
456 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  32.5 
 
 
324 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  32 
 
 
324 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  36.05 
 
 
305 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  35.22 
 
 
304 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  8.30673e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  34.23 
 
 
302 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.21 
 
 
368 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  32.1 
 
 
459 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  33.89 
 
 
379 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.79 
 
 
459 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.22 
 
 
369 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.22 
 
 
369 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.22 
 
 
369 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  35.44 
 
 
456 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  35.22 
 
 
469 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34 
 
 
307 aa  167  3e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  36.75 
 
 
297 aa  167  3e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  36.18 
 
 
308 aa  167  3e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  37.42 
 
 
295 aa  167  3e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  35.45 
 
 
307 aa  167  3e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  5.4726e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.79 
 
 
459 aa  167  3e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  38.91 
 
 
308 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.86941e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  32.72 
 
 
463 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  4.46047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  34 
 
 
307 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>