More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3328 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 
135 aa  284  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  72.87 
 
 
159 aa  204  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  65.19 
 
 
139 aa  191  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  62.41 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  68 
 
 
132 aa  187  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  64.29 
 
 
133 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  67.8 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  62.14 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  63.57 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  63.08 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 
136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  68.85 
 
 
135 aa  181  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  63.57 
 
 
133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  66.13 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  65.38 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  64.06 
 
 
137 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  63.78 
 
 
137 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  64.34 
 
 
146 aa  180  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  65.6 
 
 
131 aa  179  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  61.83 
 
 
137 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  65.62 
 
 
183 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  63.78 
 
 
137 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  60.77 
 
 
148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  63.85 
 
 
159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  62.31 
 
 
131 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 
167 aa  177  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
134 aa  177  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 
131 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 
131 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  65.12 
 
 
139 aa  176  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  60.77 
 
 
137 aa  176  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  59.23 
 
 
131 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
132 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.56 
 
 
136 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
131 aa  174  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  66.94 
 
 
132 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  65.12 
 
 
150 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  65.32 
 
 
163 aa  174  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 
131 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  59.85 
 
 
138 aa  173  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.65 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  65.08 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  61.11 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  66.94 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 
133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  61.72 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  59.23 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 
166 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  61.36 
 
 
137 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  61.42 
 
 
130 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  63.2 
 
 
131 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  66.13 
 
 
140 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 
140 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
137 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  58.52 
 
 
138 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
138 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  58.52 
 
 
138 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  63.28 
 
 
138 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 
138 aa  167  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 
147 aa  166  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 
133 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
140 aa  165  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  61.11 
 
 
136 aa  164  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
135 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  58.4 
 
 
135 aa  163  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 
132 aa  163  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
190 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  57.66 
 
 
136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 
128 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 
136 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 
165 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 
167 aa  159  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  57.6 
 
 
136 aa  159  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 
166 aa  159  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  56.39 
 
 
136 aa  159  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
164 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 
180 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 
166 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  56.69 
 
 
141 aa  158  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
165 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  59.35 
 
 
141 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 
140 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  56.72 
 
 
134 aa  157  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  56.72 
 
 
134 aa  157  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
176 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 
140 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
161 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  54.07 
 
 
136 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  58.78 
 
 
134 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  56.06 
 
 
180 aa  156  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>