More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1996 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  160  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  61.17 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  62.5 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  61.17 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  60.19 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  59.62 
 
 		 107 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  61.39 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  59.22 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  57.69 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.8 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  59.22 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  58.65 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  58.65 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  59.22 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  57.69 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  56.73 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  57.84 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  56.73 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  57.28 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  57.28 
 
 		 109 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  60.58 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  58.65 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  58.76 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  52.83 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  54.81 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  55.34 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  60.2 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  53.4 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  52.94 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.44 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  55.34 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  57.28 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  57.28 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  52.43 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  59.38 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  56.44 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  50.94 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  54.37 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  53.4 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>