216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0963 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  42.54 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 
215 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  44.04 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  39.56 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  38.94 
 
 
220 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  39.17 
 
 
248 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
221 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  39.45 
 
 
221 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  40.27 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.56 
 
 
219 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  38.64 
 
 
221 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
221 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  42.06 
 
 
213 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 
215 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  39.82 
 
 
212 aa  148  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  38.33 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 
217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  36.68 
 
 
217 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 
220 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 
216 aa  141  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 
222 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  39.21 
 
 
216 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 
215 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
227 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  35.91 
 
 
211 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  33.64 
 
 
214 aa  134  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 
210 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
215 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  35.14 
 
 
223 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 
221 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
214 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
213 aa  121  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 
224 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  33.62 
 
 
224 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
221 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  33.62 
 
 
224 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
213 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  34.68 
 
 
214 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 
220 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 
235 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
256 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
214 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
213 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
217 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 
217 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
221 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  29.2 
 
 
242 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  34.82 
 
 
221 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
215 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  32.72 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  33.64 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  32.72 
 
 
243 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
224 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  33.64 
 
 
243 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
219 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  34.53 
 
 
218 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 
221 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  32.72 
 
 
243 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
218 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.61 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  32.26 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  31.7 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  29.96 
 
 
236 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
222 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>