241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0122 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.52 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  57.69 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  42.11 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.44 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  43.48 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.25 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  45.98 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  47.62 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.53 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  43 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.94 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.75 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  46.75 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  45.05 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.96 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  43.18 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  43.18 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.13 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.44 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.68 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.86 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  43.59 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  44.16 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  42.31 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  41.25 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  42.31 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.59 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  39.74 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  43.59 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  40.51 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  40 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  34.94 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.31 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  40.24 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.03 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  38.95 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  40.24 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  38.55 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.02 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  39.02 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  39.74 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  37.78 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  39.24 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  36.14 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2640  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.62 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  40.51 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  41.03 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  38.89 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  39.74 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  39.74 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  40.74 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  39.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  38.1 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  38.46 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  39.74 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  38.46 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0254  RNA-binding S4 domain protein  41.46 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  34.15 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  42.17 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  39.74 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  34.62 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  42.68 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.68 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  37.8 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.68 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.44 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  41.03 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  37.18 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  41.46 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  38.24 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  39.74 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.46 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  31.96 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  34.62 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  39.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  40 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>