248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0376 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 369 aa  717    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  91.3 
 
 		 369 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  53.22 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.91 
 
 		 409 aa  318  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.55 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  53.45 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  54.39 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  50.59 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  47.22 
 
 		 376 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  45.95 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  45.89 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  49.85 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  50 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  47.09 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.91 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.56 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  49.56 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  48.06 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  42.46 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.12 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  48.29 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  42.93 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.12 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  44.08 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  45.05 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.97 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  48.41 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  46.61 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  46.9 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.78 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.51 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  44.35 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  42.15 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  46.38 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  42.43 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  40.18 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  30.55 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.71 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.15 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.67 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  30 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  25.45 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.75 
 
 		 339 aa  92.8  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.92 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.99 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  28.62 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  24.91 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  26.8 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  24.91 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  29.59 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.14 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.82 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.55 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  27.51 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  28.81 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  28.81 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  29.27 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.22 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  28.28 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.22 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.01 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  29.03 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26.78 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.12 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  25.24 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.85 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.04 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.16 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.75 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  26.61 
 
 		 302 aa  67  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  25.39 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.84 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  40.91 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.54 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.78 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.07 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.91 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.42 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.18 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  25.45 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.77 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.22 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.7 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 827 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.64 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.74 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.37 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.82 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  25.95 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.8 
 
 		 294 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  26.75 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.53 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.31 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>