More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0763 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0763  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
96 aa  190  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  9.31666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 
101 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  92  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  39.22 
 
 
104 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  87  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.57 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  49.47 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.17318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  50.51 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  4.86349e-08  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  49.49 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  83.6  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  83.6  1e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  82.8  1e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  82.8  1e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  82.8  1e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
104 aa  83.6  1e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  82  2e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  82  2e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  55.56 
 
 
106 aa  82.8  2e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  1.43169e-05  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  81.6  3e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.18 
 
 
104 aa  81.6  3e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
104 aa  81.6  3e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  81.6  3e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  81.3  4e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  80.9  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
104 aa  80.5  6e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
105 aa  80.9  6e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  80.5  6e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  80.9  6e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
104 aa  80.5  8e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
105 aa  80.1  9e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 
103 aa  79.7  1e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  79.7  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  79.7  1e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  79.7  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  45.83 
 
 
95 aa  78.6  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  41 
 
 
101 aa  79  2e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.09209e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  79  2e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
115 aa  79  2e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  79  2e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  79.3  2e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
115 aa  79.3  2e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.96723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  79  2e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  79  2e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  79  2e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  79  2e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  78.6  3e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  3e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
102 aa  78.6  3e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
102 aa  78.2  4e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
104 aa  78.2  4e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
102 aa  78.2  4e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
104 aa  77.8  5e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
104 aa  77.8  5e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  77.4  5e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  35.64 
 
 
103 aa  77.4  6e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  37.62 
 
 
131 aa  77.4  6e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
102 aa  77.4  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>