266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0084 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
412 aa  842  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  43.83 
 
 
405 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  43.83 
 
 
405 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  47.37 
 
 
414 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  42.55 
 
 
410 aa  342  6e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  43.13 
 
 
446 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.48 
 
 
406 aa  340  3e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  45.88 
 
 
406 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  44.14 
 
 
417 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  41.12 
 
 
401 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  41.3 
 
 
403 aa  327  2e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  41.22 
 
 
401 aa  327  2e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  41.97 
 
 
403 aa  326  4e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  41.65 
 
 
402 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.9 
 
 
400 aa  321  1e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.96 
 
 
414 aa  318  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.75 
 
 
408 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  42.62 
 
 
407 aa  313  3e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  42.35 
 
 
402 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  43.68 
 
 
402 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.88 
 
 
416 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  37.89 
 
 
412 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  40.16 
 
 
426 aa  279  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  42.12 
 
 
379 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  39.45 
 
 
434 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 
410 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  34.2 
 
 
369 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.56 
 
 
369 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
369 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.7 
 
 
416 aa  198  2e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.33 
 
 
451 aa  196  5e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.62 
 
 
412 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.25 
 
 
420 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.62 
 
 
412 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 
457 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.87 
 
 
453 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.02 
 
 
417 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.17 
 
 
372 aa  186  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.94 
 
 
411 aa  184  2e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.75 
 
 
400 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 
408 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.18 
 
 
369 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.95 
 
 
415 aa  180  5e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
408 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.65 
 
 
408 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.16 
 
 
370 aa  176  1e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.09 
 
 
408 aa  174  3e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 
461 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.22 
 
 
408 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.05 
 
 
461 aa  172  8e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
408 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.44 
 
 
409 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.94 
 
 
414 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.76 
 
 
361 aa  167  3e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.04 
 
 
376 aa  166  6e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  33.72 
 
 
367 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.94 
 
 
407 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.58 
 
 
359 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  32.2 
 
 
417 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.52 
 
 
406 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.52 
 
 
415 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.61 
 
 
501 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 
409 aa  142  1e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.98 
 
 
363 aa  140  5e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  30.87 
 
 
600 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
430 aa  134  4e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.48 
 
 
380 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.65 
 
 
405 aa  130  5e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  32.19 
 
 
1016 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.59 
 
 
431 aa  129  7e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.41 
 
 
427 aa  127  4e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.82 
 
 
409 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.83 
 
 
429 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  31.19 
 
 
453 aa  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  29.73 
 
 
431 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
425 aa  122  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 
407 aa  121  2e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  29.54 
 
 
440 aa  119  8e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 
405 aa  119  8e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 
425 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.41 
 
 
420 aa  119  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  28.61 
 
 
414 aa  119  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.72 
 
 
505 aa  118  2e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30 
 
 
409 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 
423 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  28.61 
 
 
406 aa  117  4e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.75 
 
 
428 aa  115  1e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  28.1 
 
 
414 aa  115  1e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.75 
 
 
428 aa  115  1e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.54 
 
 
501 aa  115  1e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
445 aa  115  1e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
309 aa  115  2e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.38 
 
 
419 aa  114  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.88 
 
 
335 aa  114  4e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.32 
 
 
415 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  27.64 
 
 
338 aa  112  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 
445 aa  111  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 
449 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
414 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.01 
 
 
418 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>