More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1259 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  63.14 
 
 
518 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  90.45 
 
 
513 aa  960    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  100 
 
 
512 aa  1056    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  62.38 
 
 
518 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  68.65 
 
 
517 aa  739    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  62.75 
 
 
518 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  61.06 
 
 
518 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  67.98 
 
 
518 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  67.98 
 
 
518 aa  724    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  63.82 
 
 
517 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  53.12 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  53.63 
 
 
517 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  52.73 
 
 
517 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  53.12 
 
 
517 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
530 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 
517 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
517 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  53.24 
 
 
517 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 
517 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
517 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  53.24 
 
 
517 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  49.71 
 
 
514 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
514 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  49.9 
 
 
510 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
514 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
514 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
515 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
515 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  41.88 
 
 
523 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  43.73 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  40.35 
 
 
523 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 
512 aa  395  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  40.47 
 
 
510 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  39.13 
 
 
513 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  40.81 
 
 
512 aa  385  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  38.54 
 
 
518 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  40.81 
 
 
519 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  37.23 
 
 
659 aa  343  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35 
 
 
643 aa  336  5e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
662 aa  336  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 
640 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 
658 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
658 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
658 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
644 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  36.31 
 
 
658 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
658 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
659 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  35.46 
 
 
635 aa  332  9e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
636 aa  332  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.65 
 
 
638 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.35 
 
 
641 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.15 
 
 
644 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  35.06 
 
 
639 aa  329  9e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
644 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.71 
 
 
645 aa  323  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  37.77 
 
 
642 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  37.77 
 
 
642 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.74 
 
 
636 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.65 
 
 
540 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.45 
 
 
634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.4 
 
 
560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.13 
 
 
535 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.59 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  35.07 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  36.36 
 
 
540 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.47 
 
 
668 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.65 
 
 
545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.11 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  34.83 
 
 
639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.18 
 
 
540 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.18 
 
 
540 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.14 
 
 
646 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.47 
 
 
541 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.86 
 
 
564 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.24 
 
 
544 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  36.61 
 
 
630 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.19 
 
 
542 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  33.59 
 
 
641 aa  296  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.1 
 
 
666 aa  296  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 
540 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.5 
 
 
548 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  36.18 
 
 
540 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.71 
 
 
565 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
545 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.14 
 
 
645 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.47 
 
 
690 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 
548 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.71 
 
 
549 aa  293  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.67 
 
 
649 aa  293  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.59 
 
 
540 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 
645 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.52 
 
 
641 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.39 
 
 
548 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.06 
 
 
575 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>