More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0913 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  59.83 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  48.47 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 286 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  33.19 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.77 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.09 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 252 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.82 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 244 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  33.04 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 249 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>