More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0912 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  58.43 
 
 
510 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  71.65 
 
 
512 aa  781    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  70.47 
 
 
513 aa  756    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  72.05 
 
 
512 aa  785    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  72.05 
 
 
512 aa  784    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  72.24 
 
 
512 aa  785    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  91.54 
 
 
520 aa  994    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  62.01 
 
 
509 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  71.65 
 
 
515 aa  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  71.65 
 
 
515 aa  782    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  71.65 
 
 
515 aa  781    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  70.47 
 
 
513 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  70.47 
 
 
513 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.67 
 
 
513 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  60.12 
 
 
511 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  71.65 
 
 
512 aa  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  72.05 
 
 
512 aa  780    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  71.18 
 
 
512 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  60.63 
 
 
516 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  68.14 
 
 
517 aa  749    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  70.98 
 
 
510 aa  777    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  61.81 
 
 
510 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  72.05 
 
 
515 aa  784    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  58.66 
 
 
509 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  58.86 
 
 
509 aa  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  80.04 
 
 
513 aa  860    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  70.59 
 
 
517 aa  738    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  68.47 
 
 
517 aa  748    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  100 
 
 
520 aa  1064    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  71.65 
 
 
512 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  58.2 
 
 
516 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  58.15 
 
 
511 aa  631  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.62 
 
 
516 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  58.59 
 
 
508 aa  628  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  58.32 
 
 
511 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  58.4 
 
 
517 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.09 
 
 
513 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  57.87 
 
 
506 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.15 
 
 
510 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  56.27 
 
 
510 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.23 
 
 
516 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.92 
 
 
514 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  56.97 
 
 
507 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.01 
 
 
518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  56.98 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.88 
 
 
511 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  56.5 
 
 
512 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  56.95 
 
 
523 aa  597  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  55.8 
 
 
511 aa  595  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  55.62 
 
 
529 aa  592  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  56.47 
 
 
511 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.92 
 
 
510 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  55.6 
 
 
510 aa  593  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.86 
 
 
528 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.23 
 
 
533 aa  585  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.5 
 
 
510 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  54.16 
 
 
528 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  54.04 
 
 
533 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  55.6 
 
 
511 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  55.21 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  55.64 
 
 
560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  53.38 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.55 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  55.01 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  54.35 
 
 
556 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  55.04 
 
 
518 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.65 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  56.78 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.35 
 
 
528 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.23 
 
 
526 aa  578  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  52.57 
 
 
528 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  55.17 
 
 
512 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  52.8 
 
 
528 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.47 
 
 
575 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.93 
 
 
514 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.04 
 
 
518 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  54.05 
 
 
520 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.93 
 
 
514 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  54.25 
 
 
515 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  54.13 
 
 
517 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  54.05 
 
 
526 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  53.19 
 
 
534 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.36 
 
 
520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.79 
 
 
542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  54.21 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.51 
 
 
560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  52.42 
 
 
528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.79 
 
 
542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  51.64 
 
 
542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.97 
 
 
518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  54.95 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  54.7 
 
 
525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  52.22 
 
 
528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  54.41 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  53.11 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  52.93 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  53.14 
 
 
522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.68 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.13 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  54.31 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>