196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2077 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  72.88 
 
 		 584 aa  332  5e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.26 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.21 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  46.83 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.17 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.46 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.18 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  40.75 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  35.76 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  39.3 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.39 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 312 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  38.59 
 
 		 640 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 294 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  39.57 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  41.07 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  37.2 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  41.43 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  36.12 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  37.59 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  38.23 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  37.44 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  51.61 
 
 		 120 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0250  hypothetical protein  61.22 
 
 		 51 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  27.32 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  28.57 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  28.07 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  24.91 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  26.11 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  26.19 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3758  putative ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2331  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  25.23 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>