More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3808 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.2 
 
 
571 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.2 
 
 
571 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  60.67 
 
 
571 aa  732    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 
571 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  61.2 
 
 
571 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  61.38 
 
 
571 aa  741    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  70.55 
 
 
582 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  61.38 
 
 
571 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  70.55 
 
 
582 aa  806    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  61.9 
 
 
572 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  71.13 
 
 
582 aa  799    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  99.47 
 
 
567 aa  1127    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.73 
 
 
571 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.2 
 
 
571 aa  736    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  67.91 
 
 
568 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.38 
 
 
571 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  63.32 
 
 
576 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.9 
 
 
572 aa  753    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  74.56 
 
 
565 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  78.41 
 
 
566 aa  893    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  65.08 
 
 
572 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  68.49 
 
 
584 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  100 
 
 
567 aa  1129    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  64.2 
 
 
572 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.48 
 
 
567 aa  1008    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.9 
 
 
572 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  70.95 
 
 
610 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  52.2 
 
 
572 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  44.72 
 
 
580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  43.92 
 
 
579 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  45.39 
 
 
636 aa  496  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.58 
 
 
596 aa  480  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  43.13 
 
 
582 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  40.43 
 
 
566 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 
566 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  44.17 
 
 
615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  46.84 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  46.84 
 
 
612 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  47.9 
 
 
468 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
575 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  37.93 
 
 
589 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.5 
 
 
587 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
598 aa  382  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
577 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  39.33 
 
 
597 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.41 
 
 
598 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.75 
 
 
577 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.29 
 
 
597 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  37.69 
 
 
578 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  40 
 
 
598 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.66 
 
 
606 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  37.69 
 
 
578 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  40.65 
 
 
588 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  38.34 
 
 
601 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.92 
 
 
601 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  41.55 
 
 
584 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  41.43 
 
 
617 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.79 
 
 
575 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  39.92 
 
 
550 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.24 
 
 
556 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.37 
 
 
586 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  40.52 
 
 
586 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  39.51 
 
 
582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.32 
 
 
578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  38.26 
 
 
578 aa  357  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.28 
 
 
586 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
594 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  39.88 
 
 
586 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.08 
 
 
586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.88 
 
 
586 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.88 
 
 
586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  39.06 
 
 
597 aa  352  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.7 
 
 
579 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  39.68 
 
 
586 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.33 
 
 
586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  39.04 
 
 
546 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 
586 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  40.58 
 
 
578 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.68 
 
 
586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  41.53 
 
 
579 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
611 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.31 
 
 
583 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  37.91 
 
 
610 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  37.91 
 
 
610 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  41.6 
 
 
611 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  39.41 
 
 
580 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.91 
 
 
610 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  41.75 
 
 
611 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  36.21 
 
 
602 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.25 
 
 
575 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.42 
 
 
614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.4 
 
 
591 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.49 
 
 
608 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.8 
 
 
614 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  36.38 
 
 
601 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
586 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  40.24 
 
 
587 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  37.57 
 
 
644 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.78 
 
 
625 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
650 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>